1987年，我国诞生了第一个企业孵化器——武汉东湖高新技术创业服务中心。此后，我国的企业孵化器经历了快速发展的时期。从现有文献的研究来看，较普遍的观点认为我国企业孵化器的发展分为三个阶段。
起步阶段（1987-1993年）
1988年8月，中国决定开始实行专门为发展中国高新技术产业而设立的“火炬计划”，从而启动了科技企业孵化器的建立和发展。
稳步发展阶段（1993-1996年）
这一时期，企业孵化器从提供全方位、全过程的服务逐渐过渡到为创业者直接服务，并且向准工业化发展。企业孵化器、被孵企业与大学或科研院所实现了紧密结合，呈现出创业资本支持技术、企业研发新产品、培育市场，市场收购企业、回报投资者这样完整的循环和增值过程。
提升阶段（1997-至今）
这一时期的特点是企业孵化器向网络化发展，形成了孵化器的城市网络、区域网络、全国网络和国际网络以及向营利型、国际化发展，并出现了留学生创业企业孵化器、孵化器海外基地和国际孵化网络。
经过了二十多年的发展，目前，我国科技企业孵化器的发展处于转型时期，即从典型的“综合型孵化器”向现代多种类型的“专业孵化器”发展。
前瞻产业研究院发布的《2015-2020年中国企业孵化器产业市场前瞻与发展趋势分析报告》显示，近年来，我国企业孵化器在数量上呈现持续增长的良好发展势头。2007年，我国企业孵化器数量为614家，而截至2013年底，我国各地火炬计划体系内的企业孵化器数量达到1486家，同比增长19.94%。
当前对孵化器网络化发展的关注主要集中在孵化器内部和外部的网络化两个方面，内外关系网络间的相互作用包含两层含义：首先，内部关系的网络化有助于促进外部关系的网络化，孵化器和被孵对象间的关系网络将促使孵化器更努力地寻找外部关系为被孵对象提供足够的创业资源，被孵对象间的交流与合作将加大被孵对象与外部建立联系的机会；其次，外部关系网络有助于促进孵化器与被孵对象之间信任与依存关系的增强，促进被孵对象之间的交流与合作，比如被孵对象可以结成一个整体来共同争取订单。